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上新 | 科研 or 工业?CycloneSEQ全质粒上新,灵活适配两大场景!

发布时间:2025.11.02

作者:世界杯购票官网入口

浏览量:1311

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方案特点概述


基于CycloneSEQ长读长测序平台,世界杯购票官网入口携手2026世界杯官网序风在原酶切法全质粒测序解决方案的基础上,针对当前科研和工业应用中的实际痛点,推出了CycloneSEQ全质粒测序及组装(二级条形码)解决方案,能兼容不同长度大小(2-20k)的质粒样本(不包含长homopolymer)。升级后的解决方案在捕获完整环状质粒全长序列、保留质粒结构鉴定和功能分析优势的同时,实现了“N × N” 式的条形码自由组合机制。通过可灵活适配各种样本通量并简化操作流程,有效提高设备利用率,优化整体测序经济性,兼容“科研与工业”,促进降本增效。


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流程概述


采用定制的“全质粒测序与组装试剂套装”进行文库制备,搭配CycloneSEQ 测序试剂盒、CycloneSEQ 芯片清洗试剂盒以及 G100-ER/G400-ER 平台,完成测序、芯片清洗、再次测序或芯片保存,同时使用搭载在CycloneFlow的CycPlasmidAsm分析软件可一键完成全质粒序列组装与分析。


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流程示意




* 以96(24*4)个样本,使用 G100-ER 测序为例。


图1 CycloneSEQ全质粒测序与组装 (二级条形码) 解决方案全流程示意图


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应用案例分享


均在客户真实场使用“二级条形码”技术方案及配套的“CycPlasmidAsm”软件分析得到结果。


测序下机数据结果示例


表 1 测序数据总览


注 1:576 质粒测序使用同一种质粒(约7.48 Kb),单次构建576(24 × 24) 种条形码文库,同时在G100-ER 平台上进行连续48 小时测序;

注 2:96 质粒测序使用24 种不同的质粒样本(约6 ~ 9 Kb),每种质粒构建4 个重复文库共计96(24 × 4) 种条形码文库,同时在G100-ER 平台上进行连续16 小时测序;

注 3:192 质粒测序选用192 种不同大小( 2 ~ 15 Kb)真实质粒,每种质粒构建1 个文库共计192 种条形码文库,同时在G400-ER 平台上进行连续14 小时测序;

注 4:288 质粒测序使用不同质粒(2 ~ 15 Kb ),不同起始量(单样本10 ng/25 ng/50 ng)一次构建上机文库,使用同一张芯片在G100-ER 平台上连续进行测序;

注 5:48 质粒测序使用不同质粒(> 15 Kb),不同起始量(单样本50 ng/100 ng)一次构建上机文库,使用同一张芯片在G100-ER 平台上连续进行测序;

注 :所有测试均在客户真实场景下进行,受不同芯片、样本质量(质粒降解等)因素影响,数据产出及质量会有一定浮动。


数据分析结果


CycloneSEQ 测序工作站均可按需部署CycloneFlow平台及所需自动化生物信息分析软件;支持局域内网远程互联,一键提交任务,本地自动化完成全流程分析并生成HTML 报告。


质粒测序下机数据质控示例(Read length / Read Count):优先选择性捕获质粒全长片段。


条形码拆分均一性及数据量推荐:在576(24 × 24) 个质粒测序RUN中抽取6 组不同24 个条形码质粒数据进行展示,拆分均一性CV均小于0.3且重复性好,表现优异。


抽取不同数据量(左至右分别为4Gbase/ 3Gbase/ 2Gbase)进行组装测试,576 个样本最低数据量需求2 ~ 3 Gbase即可满足组装需求(预估测序时长G100-ER:~ 5 小时,G400-ER:~ 1 小时):


组装序列一致性【准确率】(在有参考序列的情况下),相同质粒样本使用不同条形码测序时组装结果完全一致,非复杂质粒全序列比对完全一致:


表 2 相同质粒重复测序组装结果


表 3 不同质粒测序表现组装结果


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总结


本解决方案基于CycloneSEQ 测序平台及合作伙伴的试剂耗材,搭载自主开发 CycloneFlow 分析平台和软件,对下机数据采用组装、抛光等生物信息分析步骤,可获得完整质粒序列。这是一款面向全质粒测序解析且高效低成本的理想解决方案,能够帮助您更快速、更便捷、更准确地实现您的研究目标及订单交付。


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订购信息




原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/BboitWHWBf-AqA6FFqDpnQ


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