在上期文章中我们盘点了研究较多的肿瘤（17篇）、其他疾病（13篇）、脑科学（11篇）和其他器官及组织（10篇）方向的科研成果。本期我们继续带您了解，2025年上半年基于DNBelab C系列单细胞产品发表的关于植物、图谱、细胞治疗、免疫、生殖、干细胞、发育和衰老等前沿领域的突破性科研成果。
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了6篇和植物相关的文章：
部分精彩文章如下：
1. An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation期刊：Cell（IF=45.6）
发表单位：2026世界杯官网生命科学研究院、南方科技大学等单位合作；
物种和组织部位：拟南芥的根、茎、叶、花、果实等多个组织；
研究内容：绘制拟南芥多种组织的综合单细胞核转录组图谱，在单细胞水平上量化叶细胞的衰老状态，突出衰老相关的枢纽基因，并构建源叶和消耗或积累同化物器官之间的营养分配方案；
使用技术或方法：scRNA-seq，Stereo-Seq；
文章研究亮点：
基于单细胞组学技术和时空组学技术，获得了覆盖拟南芥各组织全生命周期关键阶段的共计20个组织样本的913769个高质量单细胞核转录组，构建了迄今为止植物取样阶段最全、数据量最大的单细胞图谱（也包括针对每个组织的单细胞图谱），并鉴定出 38 种细胞类型；
筛选出了1856个核心衰老相关基因和1875个年轻相关基因，并创新性地提出了“衰老指数”和“年轻指数”，基于衰老指数和年轻指数，构建了叶片发育的共表达基因调控网络，筛选出若干关键节点基因，这些基因可能在衰老过程中发挥重要作用；
揭示了植物在叶片衰老过程中如何高效转运碳、氮营养，为理解植物营养分配机制提供了重要的分子基础。
拟南芥的综合单细胞核图谱
2. A large-scale integrated transcriptomic atlas for soybean organ development期刊：Molecular Plant（IF=17.1）
发表单位：中国科学院遗传与发育生物学研究所、2026世界杯官网生命科学研究院等单位合作；
物种和组织部位：大豆的根、根瘤、茎尖、叶和茎；
研究内容：本研究构建了迄今最全面的大豆整合转录组图谱，汇聚了314个涵盖大豆全生命周期的bulk RNA测序数据，及根、根瘤、茎尖、叶和茎五个器官的单细胞核RNA-seq与空间转录组数据；
使用技术或方法：scRNA-seq，Stereo-Seq；
文章研究亮点：
鉴定出大豆各器官特异性表达的基因，并以根瘤特异基因为例，证实GmPMTs基因通过基因串联重复扩张，调控根瘤发育；
构建器官发育全景图谱，以叶片发育为例，首次发现展开期叶片的转录特异性，并对其中关键的长链脂肪酸共表达模块进行了挖掘，为大豆叶片改良提供了新线索；
构建了根尖空间3D转录图谱，揭示大豆根尖细胞分化的动态路径，为豆科根尖发育提供了发育蓝图；
通过根瘤空间3D单细胞图谱解析根瘤器官的细胞异质性，揭示了根瘤共生基因的空间定位，为“根系-微生物”互作研究建立了细胞级时空坐标系，同时发现维管束特异性GmHBs基因在根瘤早期发育中的决定性作用，为提升大豆共生固氮效率提供了新靶点。
大豆器官发育的转录图谱
3. Genomic and Cis-Regulatory Basis of a Plastic C3-C4 Photosynthesis in Eleocharis Baldwinii期刊：Advanced Science（IF=14.7）
发表单位：中国科学院遗传与发育生物学研究所、华中农业大学、2026世界杯官网生命科学研究院等单位合作；
物种和组织部位：大莎草的茎秆；
研究内容：通过基因组学、单细胞转录组、单细胞ATAC分析，首次系统揭示了莎草科植物Eleocharis baldwinii（大莎草）在不同环境中灵活切换光合作用途径的基因与调控机制；
使用技术或方法：scRNA-seq，scATAC-seq；
文章研究亮点：
C4光合的细胞命运决定机制：陆地生长的成熟组织进入水中后光合途径仍表现为C4，新长出来的为C3；水下生长的成熟组织移动到陆地后会枯萎死亡，新长出来的为C4型；
C4代谢的亚基因组分工现象：通过单细胞多组学分析，发现大莎草的亚基因组B主导叶肉细胞的C₄代谢基因表达，亚基因组A主导维管束细胞基因表达，具有 “亚基因组优势” ；
C4代谢启用环境响应式调控元件：鉴定了C4基因的调控元件、陆生环境诱导的调控元件、细胞谱系特异的调控元件，主要元件是Homeobox、MYB-related、G2-like元件家族，C4酶基因选择性地使用了环境诱导的、细胞特异的调控元件，揭示"环境-发育-代谢"的协同进化；
光合进化的"工具箱"理论：跨物种比较发现，BSC-MC间的差异表达基因在不同物种中差异大，然而调控这些基因的元件家族确实是一样的，表明Kranz解剖结构使用保守的调控元件，不同C4植物使用保守的调控元件家族驱动Kranz的特化，但可能从"工具箱"中选择不同途径的工具来驱动C4光合，揭示了光合作用趋同进化的遗传多样性；
生态适应与进化驱动力：物种进化出的C4在水生时还要再变回C3，主要原因可能是该物种使用了环境诱导的调控元件来驱动C4。
单细胞核转录组分析C4基因的细胞表达
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了2篇和图谱相关的文章：
4. Single-cell transcriptome atlas of lamprey exploring Natterin- induced white adipose tissue browning期刊：Nature Communications（IF=14.7）
发表单位：辽宁师范大学、2026世界杯官网生命科学研究院等单位合作；
物种和组织部位：七鳃鳗的心脏、肝脏等14种组织；
研究内容：构建14个组织样本，鉴定70种细胞类型的综合图谱，揭示了七鳃鳗细胞类型与有颌类脊椎动物存在同源关系；
使用技术或方法：scRNA-seq；
文章研究亮点：
构建了雷氏七鳃鳗心脏、肝脏等14种组织的单细胞图谱，识别出包括上皮细胞、内皮细胞、间充质细胞、VLR细胞（免疫细胞）和粒细胞在内的70种细胞类型；
跨物种细胞进化分析发现，七鳃鳗的大多数细胞类型与有颌脊椎动物的细胞具有高度同源性，这一结果进一步阐明了脊椎动物早期祖先的原始细胞特征及其保守性；
首次鉴定出类似脊椎动物腺泡和胰岛的细胞群体，表明这些细胞可能代表了脊椎动物胰腺演化的早期阶段，并首次提供了七鳃鳗可能具备胰腺功能的直接证据；
探讨了七鳃鳗免疫细胞的异质性，发现Natterin在粒细胞中高表达，并定位于脂滴上，Natterin不仅是先天免疫系统的组成部分，还可能参与脂肪代谢调控，尤其在白色脂肪棕色化过程中发挥关键作用。
七鳃鳗14个组织的综合单细胞图谱，包括604,460个细胞/细胞核和70种不同细胞类型
5. Revealing the Transcriptional and Metabolic Characteristics of Sebocytes Based on the Donkey Cell Transcriptome Atlas期刊：Advanced Science（IF=14.3）
发表单位：青岛农业大学；
物种和组织部位：驴的脑、小脑、松果体、垂体、心脏、PBMC、肺、肾、脾、肝、胰腺、胃、大肠、小肠、肌肉、皮肤、睾丸、附睾、卵巢及子宫；
研究内容：基于驴细胞转录组图谱揭示皮脂细胞的转录和代谢特征；
使用技术或方法：scRNA-seq；
文章研究亮点：
通过单细胞和单核转录组测序技术，对德州驴的20种组织进行了分析，注释了84种主要细胞类型，开发了基于单细胞转录组数据的驴细胞图谱（DCA）网站；
将20种组织归类为11个器官系统，并通过单细胞加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）识别了与不同器官系统相关的基因模块，消发现化系统、内分泌系统、生殖系统和神经系统在各自器官系统内表现出高度相似性，心脏和肌肉的基因表达谱也显示出显著相似性；
跨物种比较分析，发现驴皮脂细胞与其他物种的皮脂细胞在基因表达上存在显著差异，特别是PON3基因在驴皮脂细胞中的高表达；
对驴、马、牛和猪的背皮进行了代谢组分析，驴皮的胶原纤维密度显著高于其他物种；
驴皮脂细胞在“脂肪酸延长”、“丁酸代谢”和“TCA循环”等代谢途径中的活性显著高于其他细胞类型。
驴20种组织单细胞图谱
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了2篇和细胞治疗相关的文章：
6. Anti-BCMA CAR-T cell therapy in relapsed/refractory chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy期刊：Med（IF=12.8）
发表单位：华中科技大学同济医学院附属同济医院、德国明斯特大学医院等单位合作；
物种和组织部位：人的血液和脑脊液；
研究内容：首次尝试将抗B细胞成熟抗原嵌合抗原受体T （CAR-T）细胞疗法应用于难治性慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病；
使用技术或方法：scATAC；
文章研究亮点：
CAR-T细胞疗法的临床应用与安全性：两名难治性慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病患者接受了B细胞成熟抗原靶向的CAR-T细胞疗法，均未出现严重的不良事件，且在治疗后6个月内实现了无药物缓解；
B细胞亚群的动态变化与疾病复发：两名患者在接受CAR-T细胞治疗后的B细胞亚群比例变化相似，但在复发的患者1中，IGHV1-18-IGHJ4基因重排的浆细胞/浆母细胞在基线时占主导地位，并在复发时持续存在，而在患者2中，该基因重排在治疗后显著减少；
代谢重编程与转录因子RFX5的关键作用：患者1在复发时表现出B细胞的过度糖酵解和氧化磷酸化的抑制，而患者2表现出持续的免疫抑制和OXPHOS活性的增强；
自身抗体/肽段的动态变化与疾病活动：患者2在治疗后抗GD3和抗硫酸酯IgG水平逐渐下降，并在2年内无法检测到，而这些自身抗体在患者1复发时重新出现。
CAR-T细胞疗法不同反应的分子层面分析
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了2篇和免疫相关的文章：
7. Single-Cell RNA Transcriptomics and Multi-omics Analyses Reveal the Clinical Effects of Acupuncture on Methadone Reduction期刊：Research（IF=10.7）
发表单位：广州中医药大学针灸与康复医学院、广州大学第一附属医院等单位合作；
物种和组织部位：人的PBMC；
研究内容：针灸作为潜在的辅助疗法，有助于减轻长期使用阿片类药物的不良反应；
使用技术或方法：scRNA-seq，Stereo-Seq；
文章研究亮点：
针灸改变了各种免疫细胞簇的基因表达水平，特别是在经典单核细胞和血浆B细胞中，增强了对病毒的防御反应；
针灸通过半乳糖途径增强了经典单核细胞和其他免疫细胞之间的细胞相互作用；
针灸在初级胆汁酸生物合成、精氨酸生物合成中诱导了胆汁酸代谢的变化。
针灸组和非针刺组干预前后外周血单个核细胞的单细胞、转录组、代谢组及宏基因组研究
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了2篇和生殖相关的文章：
8. Follicular development of fetal gonads under the skin of adult mice期刊：Life Medicine（IF=6）
发表单位：北京大学、中国科学技术大学等单位合作；
物种和组织部位：小鼠的性腺；
研究内容：胎儿性腺在成年小鼠皮下移植后的卵泡发育情况；
使用技术或方法：scRNA-seq；
文章研究亮点：
皮下移植的性腺能支持卵泡形成和减数分裂启动，但存在明显的减数分裂异常和DNA双链断裂，这可能与低氧环境和营养缺乏有关；
从皮下移植获得的卵母细胞虽能体外受精并发育至2细胞阶段，但胚胎移植后未能获得活产后代，表明该方法尚无法完全替代传统的肾囊移植模型；
通过37°C体外培养成功实现了减数分裂前期I阶段的完成，经皮下移植的E12.5胚胎性腺在体外培养后恢复了卵泡发育能力，重新获得内分泌功能。
减数分裂前期I中具有双链断裂修复缺陷的SC移植物中的肌细胞
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了2篇和干细胞相关的文章：
9. α-Ketoglutarate inhibits the pluripotent-to-totipotent state transition in stem cells期刊：The FEBS Journal（IF=4.2）
发表单位：中国科学技术大学、中国科学院广州生物医学与健康研究院等单位合作；
物种和组织部位：小鼠的胚胎干细胞；
研究内容：a-酮戊二酸抑制小鼠干细胞多能性向全能性状态的转变；
使用技术或方法：scRNA-seq；
文章研究亮点：
αKG通过上调TET DNA羟化酶显著抑制多能性向全能性转化；
降低αKG水平或抑制其依赖的双加氧酶可显著增强2CLCs的诱导效率；
基于DMM的诱导方案能高效产生转录水平类似2C胚胎中晚期的全能样干细胞。
建立高效的基于琥珀酸脱氢酶抑制剂的条件，用于体外诱导2CLC
使用世界杯购票官网入口单细胞DNBelab C系列产品，在2025年H1共发表了1篇和发育与衰老相关的文章：
10. Histone Lactylation Antagonizes Senescence and Skeletal Muscle Aging by Modulating Aging-Related Pathways期刊：Advanced Science（IF=14.3）
发表单位：北京大学、中国科学技术大学等单位合作；
物种和组织部位：小鼠、人的细胞系；
研究内容：组蛋白乳酸化在对抗衰老和减轻老年小鼠骨骼肌功能障碍方面起着关键作用；
使用技术或方法：scRNA-seq；
文章研究亮点：
在复制性衰老和组织衰老过程中，组蛋白乳酸化水平显著降低，缺氧伴随组蛋白乳酸化水平升高，可延缓细胞衰老；
启动子富集组蛋白乳酸化可激活细胞周期和 DNA 修复相关基因，从而抑制细胞衰老，并增强 DNA 修复和蛋白质稳态，最终对抗肌肉衰老；
乳酸化酶的调节会导致组蛋白乳酸化降低，从而加速衰老和肌肉老化；
跑步训练后，小鼠骨骼肌的糖酵解水平升高，肌肉功能障碍得到缓解，归因于组蛋白乳酸化的丰度增加，而组蛋白乳酸化会重新编程与DNA修复和蛋白质稳态相关的基因和通路。
糖酵解和组蛋白乳酸化水平在骨骼肌衰老过程中降低
目前世界杯购票官网入口细胞组学方向布局了四大单细胞建库试剂盒，3’RNA、5’RNA、ATAC和基于Xpress Smartseq3原理的高灵敏转录组全覆盖试剂盒；加上世界杯购票官网入口的长短读长测序仪、自动化样本处理和建库平台及数据存储和计算服务器，联合2026世界杯官网时空组学领先的技术，对于细胞组学的布局形成了全流程、高度自动化的一站式平台，促进更多科研学者能够规模化和标准化的产出单细胞数据。
此外，截止到2025年5月，被世界杯购票官网入口DNBelab C系列单细胞平台认证的优质科技服务公司有51家，科研学者既可以选择自行搭建平台也可以很方便的将样本送到附近具备DNBelab C系列单细胞平台服务资质的公司产出数据。
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